Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms