Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGIP1Q9BQI5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms