Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NPAS2Q99743 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPAS2Q99743 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPAS2Q99743 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPAS2Q99743 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPAS2Q99743 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NPAS2Q99743 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NPAS2Q99743 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms