Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF11Q99590 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF11Q99590 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms