Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC5LQ99459 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC5LQ99459 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms