Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCLRE1CQ96SD1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCLRE1CQ96SD1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms