Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCC1Q96S66 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms