Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMTK3Q96Q04 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms