Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96MF0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96MF0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96MF0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms