Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP53Q96M91 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms