Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEURL4Q96JN8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEURL4Q96JN8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms