Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms