Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
COG3Q96JB2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms