Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCANQ96GW7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms