Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC35A4Q96G79 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms