Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms