Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTSSAQ969W0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms