Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC1AQ92747 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms