Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF3Q92576 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms