Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms