Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND90

PNMA1, Paraneoplastic antigen Ma1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA1Q8ND90 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PNMA1Q8ND90 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms