Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms