Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms