Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KNDC1Q76NI1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KNDC1Q76NI1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms