Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
XIRP1Q702N8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP1Q702N8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms