Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms