Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms