Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF7Q6Q0C0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF7Q6Q0C0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms