Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC137Q6PK04 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms