Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms