Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms