Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD1Q5T700 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms