Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBK1Q52WX2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms