Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDCCQ504Y2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms