Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC38Q502W7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms