Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms