Protein–RNA interactions for Protein: Q2M389

WASHC4, WASH complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC4Q2M389 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC4Q2M389 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC4Q2M389 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms