Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC142Q17RM4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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