Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CDO1Q16878 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDO1Q16878 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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