Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2SQ16763 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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