Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM1Q16610 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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