Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC1Q15915 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC1Q15915 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms