Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms