Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX1Q15699 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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