Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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