Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
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