Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTF1Q15361 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTF1Q15361 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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