Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRRQ15256 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms