Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCOLCEQ15113 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms