Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF1Q14162 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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